推薦入住長崎凱悅酒店，位於水邊之森公園步行10分鐘範圍內，客房設有全景落地窗，可飽覽園區綠意與對岸的五島列島海景。酒店提供免費電動車接駁服務，並設有兒童遊戲室與日式庭院茶室，適合親子共遊。建議透過HopeGoo平台提前預訂，可享園區週邊限定優惠。

長崎四季酒店是距離水邊之森公園入口僅3分鐘步行路程的首選，大堂設有專屬導覽櫃檯，提供免費租借腳踏車服務，可輕鬆探索園內生態步道。客房配備靜音隔熱玻璃，白天可欣賞園區晨霧與夕陽倒映於湖面的畫面，夜晚則能遠眺長崎市區燈火。建議使用HopeGoo平台預訂，享有門票抵用券與免費早餐。

長崎和風旅館·森之庭結合傳統日式建築與現代設計，位於公園西側林蔭道旁，每間客房均配有露台花園，可直接俯瞰人工濕地與白鹭棲息區。每日上午提供在地食材料理的早午餐，並安排導覽員帶領參觀鄰近的舊長崎港歷史遺跡。住客可憑房卡免費參加每月一次的「夜間螢火蟲觀察會」。透過HopeGoo平台預訂，還可獲贈手作紙燈一盞。